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《自然》子刊:80%转移性肠癌不到芝麻粒大的时候 就转移到肝或大脑了

2019-06-21 奇点糕 / 奇点网
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根据现行的癌症分期方法,癌症可以笼统地被分为早期、中期和晚期。这个分类方法不仅很好的慨括了癌症的特点,而且还通俗易懂地向大众传递了癌症的严重程度。

如果被确诊的癌症是早期,肿瘤挺老实的待在原地,患者和家属都会长吁一口气,心里默念“幸好发现的早”;如果确诊时是晚期,那就是癌症已经扩散转移了,医生一般会选择先和家属谈。

相比之下,由斯坦福大学医学院的医学和遗传学助理教授Christina Curtis联合其他4所研究机构,于近日发表在著名期刊《自然·遗传学》上的研究[1],就有些让人不安了。

Christina Curtis本尊(http://med.stanford.edu,Paul Sakuma摄)

他们分析了近3000名患者的基因数据,通过三维计算机模拟分析,发现高达80%的转移性结直肠癌,可能在原始肿瘤长到罂粟种子大小(约0.01立方厘米,100万个癌细胞,比芝麻粒还小)之前,就扩散到体内的其他地方了。而这个大小,目前在临床上是检测不到的。来自中国的三位青年才俊Hu Zheng,Ding Jie和Ma Zhicheng是论文的前三位作者。

“这一发现非常令人惊讶,”Christina Curtis博士说[2]。“这表明癌症在诞生之初就获得了转移能力。显然,我们的结论与转移发生在癌症晚期这个流行假设相反,会对患者分期、治疗和早期检测产生一定的影响。”

三位中国青年才俊(左→右对应上一段的名字)

转移是癌症导致死亡的主要原因,不过癌症转移的时间,以及决定癌细胞转移的关键分子机制在很大程度上还不清楚[3,4]。而这两点对于癌症的临床诊断和治疗,有重要价值。

进入21世纪,我们都认为癌症是一种基因病,癌细胞的产生和转移,是体细胞逐渐积累基因突变导致的,因此主流观点认为,当肿瘤发展到一定程度之后,会有一部分细胞获得转移的能力[5,6]

然而,近年来,已经有研究人员在早期乳腺肿瘤患者体内发现扩散出去的肿瘤细胞[7],在早期乳腺癌[8]和胰腺癌[9]的小鼠模型中,研究人员也发现了播散出去的肿瘤细胞。

 Christina Curtis实验室的主页,非常有科技感

这就让一些研究人员对主流观点产生了质疑。还有一些科学家被这些新发现吸引,他们想知道,如果癌细胞能在肿瘤形成的早期就开始扩散,那么究竟有多早呢?触发的机制又是什么呢?

要解答上面的问题,科学家必须同时研究原发病灶的肿瘤和转移灶的肿瘤。然而,同时在大量患者身上获取两处肿瘤组织有一定的难度,因此,目前还没有研究能评估人类癌症的转移时间。

因此,寻找合适且足够的研究材料,成为这个问题的关键突破口。

肠癌(mskcc.org)

Christina Curtis博士团队将宝压在了肠癌上。

肠癌发病率和死亡率都比较高[10],且研究的比较多,因此肠癌的驱动基因与疾病发展之间的关系也相对比较清楚[5]。而且肠癌的主要转移对象肝脏[11],和罕见转移对象大脑[12],也能通过切除获取转移灶肿瘤组织。

虽然目前肠癌转移的主流模型也是肿瘤经过一系列的克隆进化之后,到晚期才转移[5]。但是也有数据证明,肠癌也是“天生的坏种”,在肿瘤诞生的早期就具备了转移的能力[13]

如此看来,肠癌确实是个合适的模型。

肠道(该图片由LJNovaScotia在Pixabay上发布)

研究人员在多个研究队列中,找到23例存在肝转移或者脑转移的肠癌患者。其中10例脑转移患者有72份组织活检样本,13例肝转移患者有46份组织活检样本。研究人员给这118个组织样本做了全外显子基因组测序分析,以便从中发现肠癌转移的路径和时间。

研究人员将原发灶与转移灶的基因突变做了个比对,发现原发灶和转移灶的癌症驱动基因之间保持了高度的一致性。KRAS,TP53,SMAD4等的突变在原发性和转移性肿瘤也是一致的。此外,这两处的肿瘤也可能共享SNV和小插入缺失。

 

原发灶和转移灶基因变异情况几乎一样啊(竖虚线之间是一位患者的数据原发灶或者两个转移灶)

基于上面的基因变异数据,研究人员给每位患者的肿瘤发展历程做了个进化树,这就相当于给癌细胞做了个家谱,看看他们一代代是如何传递下去的。

基于这些进化树,研究人员清晰地发现,在可以分析的21名患者中,有17名患者的转移灶是从一小撮癌细胞,甚至是一个癌细胞发育而来,而且从整个进化树来看,这些形成转移灶的细胞形成于肿瘤发展的早期。这就暗示,在肠癌诞生的初期,这些形成转移灶的癌细胞就离家出走了。


肠癌发家史

那这个早期到底是多早呢?

或者换个更直观的说法:癌细胞开始离家出走的时候,肿瘤有多大呢?

对于这个问题,目前这个进化树模型是难以回答的。不过这也难不倒在计算生物学方面受过专业训练的Christina Curtis博士。

她带领团队开发了一个三维计算模型[13],这个模型可以模拟在不同的参数条件下肿瘤的大小,及其与疾病进展和基因变异之间的关系。

有了这个模型,他们很快就算出了21名患者癌细胞转移时的肿瘤大小。结果,那17名(83%)早期转移的患者,转移的真是非常早啊。在肠道肿瘤体积不足0.01立方厘米,也就是不到100万个细胞的时候,一部分癌细胞就已经离家出走了。

甚至有4名患者,在肿瘤只有1万个细胞,体积只有0.0001立方厘米的时候,就转移了。。。这也太早了吧~

从理论上讲,体积小于0.01立方厘米的肿瘤,在临床上是检测不到的。这就意味着,对于那17位患者而言,几乎是肿瘤一诞生,就是晚期。这些癌细胞那真是配得上“天生的坏种”这个称呼。

转移时肿瘤的大小,红框内是同一患者的两组数据

可以看到肿瘤体积为0.0001立方厘米、10000个细胞时,发生转移的4位患者

那这些“天生的坏种”有没有什么特点呢?

研究人员又调用了MSK-Impact[14]和GENIE[15]研究中2751名肠癌患者的测序数据。这2751名患者诊断结果明确,有938名患者为IV期转移性肠癌患者,另外的1813名患者为I-III期的早期肠癌患者;此外,这些患者的基因变异数据也比较完整。

将这些数据与上面的结果相结合,研究人员有了不小的发现。

“我们发现特定的突变组合可以预测转移,”Christina Curtis博士说。例如,一个名为PTPRT的基因突变与经典结直肠癌驱动基因的突变相结合,几乎只在转移性癌症患者中出现。

肠癌的进化转移史

之前有研究表明,PTPRT功能的丧失会增加一个名为STAT3蛋白的活性,从而增强了细胞的存活能力[16],因此STAT3有可能是个不错的抗癌靶点。

此外,PTPRT的基因突变或许还可以用于指导患者的治疗。如果切下的早期肿瘤中发现这个基因变异,或许可以考虑全身辅助化疗。当然,这个还需要临床研究去验证。

总的来说,Christina Curtis博士团队的这个研究表明,肠癌的转移可以发生在肿瘤形成的初期。现在看来,人类迫切需要一种能检测这些难以发现恶性肿瘤的方法。希望研究液体活检的科学家们继续努力。

参考资料:

[1].Zheng Hu, Jie Ding, Zhicheng Ma, et al. Quantitative evidence for early metastatic seeding in colorectal cancer[J]. Nature Genetics, 2019.

[2].http://med.stanford.edu/news/all-news/2019/06/most-metastatic-colorectal-cancers-have-spread-before-diagnosis.html

[3].Turajlic S, Swanton C. Metastasis as an evolutionary process[J]. Science, 2016, 352(6282): 169-175.

[4].Lambert A W, Pattabiraman D R, Weinberg R A, et al. Emerging biological principles of metastasis[J]. Cell, 2017, 168(4): 670-691.

[5].Jones S, Chen W D, Parmigiani G, et al. Comparative lesion sequencing provides insights into tumor evolution[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2008, 105(11): 4283-4288.

[6].Campbell P J, Yachida S, Mudie L, et al. The patterns and dynamics of genomic instability in metastatic pancreatic cancer[J]. Nature, 2010, 467(7319): 1109-1113.

[7].Sanger N, Effenberger K E, Riethdorf S, et al. Disseminated tumor cells in the bone marrow of patients with ductal carcinoma in situ[J]. International Journal of Cancer, 2011, 129(10): 2522-2526.

[8].Hosseini H, Obradovic M M, Hoffmann M, et al. Early dissemination seeds metastasis in breast cancer[J]. Nature, 2016, 540(7634): 552-558.

[9].Rhim A D, Mirek E T, Aiello N M, et al. EMT and Dissemination Precede Pancreatic Tumor Formation[J]. Cell, 2012, 148(1): 349-361.

[10].Siegel R L, Miller K D, Fedewa S A, et al. Colorectal cancer statistics, 2017.[J]. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 2017, 67(3): 177-193.

[11].Vatandoust S, Price T J, Karapetis C S, et al. Colorectal cancer: Metastases to a single organ.[J]. World Journal of Gastroenterology, 2015, 21(41): 11767-11776.

[12].Christensen T D, Spindler K G, Palshof J A, et al. Systematic review: brain metastases from colorectal cancer—Incidence and patient characteristics[J]. BMC Cancer, 2016, 16(1): 260-260.

[13].Sottoriva A, Kang H, Ma Z, et al. A Big Bang model of human colorectal tumor growth[J]. Nature Genetics, 2015, 47(3): 209-216.

[14].Yaeger R, Chatila W K, Lipsyc M, et al. Clinical Sequencing Defines the Genomic Landscape of Metastatic Colorectal Cancer[J]. Cancer Cell, 2018, 33(1).

[15].AACR Project GENIE Consortium. AACR Project GENIE: powering precision medicine through an international consortium[J]. Cancer discovery, 2017, 7(8): 818-831.

[16].Zhang X, Guo A, Yu J, et al. Identification of STAT3 as a substrate of receptor protein tyrosine phosphatase T[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2007, 104(10): 4060-4064.

原标题:《自然》子刊:惊了。。斯坦福科学家首次用人体数据证实,80%的转移性肠癌在不到芝麻粒大的时候,就转移到肝或大脑了丨科学大发现

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